Ennen pitkää havainnot joutuivat kritiikin kohteiksi, koska ne alkoivat vaikuttaa mielikuvituksen tuotteilta. Riitaannuttuaan lehtien kanssa Brenner alkoi julkaista omaa lehteään Astronomische Rundschau, joka ilmestyi 1899-1909. Brennerin loppuvaiheet ovat epäselvät; ilmeisesti hän elätti itsensä kirjoittelemalla, ensin Yhdysvalloissa ja sittemmin Itävallassa ja Saksassa.